普通は免疫は自分の体以外のものに対して作用しますが、自分の体の一部に対する抗体をつくり攻撃してしまうことがあります。これを「自己免疫」といいます。

甲状腺の細胞膜には脳下垂体から分泌されるTSHの刺激を受けるTSH受容体があります。バセドー病はこのTSH受容体を刺激する自己抗体が多くつくられて甲状腺を刺激してしまう病気です。